提起慢性结肠炎人们就会想到腹痛、腹泻或便秘等临床症状，事实上慢性结肠炎还必须具备肠镜下黏膜充血、水肿的表现，现在在国内有许多医院纤维结肠镜检查报告中，提示为“慢性结肠炎”的比例比较高。
与克隆病和溃疡性结肠炎不同的是慢性结肠炎的肠粘膜炎症性改变更轻，在纤维结肠镜下的表现主要是肠段粘膜的充血，血管网络模糊，血管网络偏粗，粘膜发红或因苍白而光亮，有些可见粘膜粗糙。这就是通常结肠镜的检查报告中所描述的“肠粘膜充血，血管网模糊，粘膜?水肿，反光增强”等。这些病变常常只累及直肠和乙状结肠，累及全结肠的几乎未见。
