肛周脓肿破溃或切开后，脓汁流出疼痛消失，但留下了脓腔和窦道，如炎症再发则形成肛瘘。
脓汁排出后肛周脓肿暂告一段落，患者疼痛缓解，但不要高兴得过早，肛门直肠周围形成的脓肿，大部分发展成肛瘘.这样的患者必须注意后期治疗。所谓肛瘘就是形成了脓的窦道。肛门直肠周围脓肿为什么会发展为肛瘘呢?下面讲一下发生机制。
我们回顾一下，起于肛门小窝的炎症向齿状线以下扩散形成肛周脓肿，向上扩散至直肠周围形成脓肿成为直肠脓肿。在此过程中，脓肿自然破溃排脓也好，切开排脓也好，脓汁引出后，都会留下脓腔和窦道，从外观上看切口闭塞、脓腔变小，好像已经治愈了。
可是实际上窦道和脓腔不可能消失。二者基本上就是病根了。如前所述肛窦即病灶的人口，其形态特点很容易使粪便积聚。一次炎症消退后，因粪便再次积聚，粪便中含大量的细菌而使炎症极易复发。
这样炎症复发、脓腔形成、脓汁排出，反反复复，脓汁可以从原来的口排出，也可以另觅他径，反复发作形成多个窦道，严重时肛门周围就像大树根一样。肛门周围因有脓而变得粘糊糊的，很容易形成湿疹及疣状物。
一般情况下，肛瘘不疼，炎症反复发作，窦道也开开合合。窦道闭合时脓汁贮留，与肛周脓肿一样既有疼痛也有发热，只是疼痛略轻。把肛周脓肿比作火山喷发的话，窦道和脓腔可以看成是休眠的火山。
小的火山反复喷发产生新的喷火口即窦道。 火山大喷发，肛周脓肿疼痛剧烈，小喷发疼痛轻微，脓汁由“火山口”流出，疼痛消失又形成一个窦道，因此有脓的窦道不手术是不可能治愈的。直肠周围积脓时为了与肛周脓肿相区别被称为直肠周围脓肿。这种情况少见，与肛周脓肿相比较更容易误诊。
