大部分肛门异常囊肿都发生在肛管或肛缘皮肤上，多为鳞状上皮癌，也有少数为基底细胞癌。生长在齿线的是肛管癌；生长在齿线下方是肛门周围癌或肛门缘癌。
肛管癌多见于女性，肛门周围癌男性多见。本病发生原因尚不清楚，文献介绍与下列因素有关：慢性炎症，如肛瘘、肛裂、化脓性汗腺炎、肛门扁平疣 、肛门白斑、骶尾部畸胎瘤等，均可视为癌前期病变。由于慢性长期刺激，引起细胞退行性变化，失去正常再分化能力，以致癌变。患病后的临床表现：
（1）肛管癌 疼痛是主要症状，呈持续性，便后加重。大便习惯有改变，次数增多，有排粪不净的感觉。开始有少量便血，随病情发展而加重。直肠指诊在早期为疣状肿物，可活动；较大病变可有溃疡形成，较硬并有压痛，活检可以定性。
（2）肛周囊肿 患者诉述肛缘有小肿块，生长缓慢，常有不适和肛门痒，一般不痛，如已侵犯到肛管或括约肌则有疼痛。较大病变有溃疡形成，有压痛及便血。凡肛门周围有较硬的肿块并有溃疡常提示为癌。腹股沟淋巴结是转移的好发部位，也可向盆腔淋巴结转移.
