慢性腹泻可由慢性消化系疾病、消化系以外的慢性病变以及其他原因而引起。病因主要为器质性或为功能性。包括慢性细菌性痢疾、阿米巴病、梨形鞭毛虫病、结肠小袋纤毛虫病、肠滴虫病等原虫感染，血吸虫病 .
（一）肠道感染
包括慢性细菌性痢疾、阿米巴病、梨形鞭毛虫病、结肠小袋纤毛虫病、肠滴虫病等原虫感染，血吸虫病、旋毛虫病等蠕虫感染和白色念珠菌等真菌感染。
（二）小肠吸收不良
1、结合胆酸缺乏：严重肝病（如胆汁性肝硬化、长期胆道梗阻）、新霉素及消胆胺等药物影响脂肪微胶粒形成和克隆病等回肠疾病可出现结合胆酸缺乏，导致慢性腹泻。
2、胰源性：慢性胰腺炎、胰腺癌和囊性纤维化等胰腺病变，先天性胰酶缺乏症和肠激酶缺乏症，均使小肠内胰酶不能被肠激酶激活，出现胰源性腹泻。
3、细菌过度生长：盲襟综合征、肠多发性狭窄（如克隆病）、肠结核及放射性肠炎、胃结肠瘘、部分肠梗阻和系统性硬化症等疾病。
4、肠黏膜淤血：肝硬化门脉高压、门静脉或肝静脉阻塞和右心功能不全。
5、原发性肠黏膜细胞异常：双糖酶和单糖酶缺乏症和-脂蛋白缺乏症。
6、小肠黏膜病变：乳糜泻、嗜酸粒细胞性胃肠炎、肠道淀粉样变、放射性肠炎等小肠黏膜病变。
7、淋巴梗阻：肠道淋巴瘤、肠系膜淋巴结结核、肿瘤转移和肠道淋巴管扩张征。
（三）肠道肿瘤
小肠淋巴瘤、肠道恶性组织细胞病、结肠癌和结肠绒毛状腺瘤等。
（四）肠道病变
慢性非特异性溃疡性结肠炎、克罗恩病、放射性肠炎、家族性结肠多发性息肉病及不完全肠梗阻。
（五）功能性腹泻
肠易激综合征等。
（六）全身性疾病
尿毒症、系统性红斑狼疮、系统性硬化症、恶性贫血、肢端皮炎性肠病和甲状腺功能亢进症。
（七）药物性
服用甲状腺素、抗酸剂、洋地黄类、铁剂及利尿剂等
温馨提示：结肠水疗仪
适应症：
1、习惯性便秘、腹泻；
2、慢性结肠炎的治疗；
3、手术、肠镜检查的准备处理。
结肠水疗仪是当今国际流行的一种排毒、改善便秘、纠正腹泻、促进肠道血液循环、预防肠癌的物理性内调保健自然疗法。
结肠水疗是利用水波刺激肠蠕动，并使肠壁充分吸收水分，使肠道变得滋润，浸泡软化掉肠皱襞上粘结的宿便，使之脱落下来，当达到排泄压力时，便顺其自然的排泄出去，整个过程四、五十分钟，可以使1.5米的大肠变得洁净，整个治疗过程最严重的反应就是有点闹肚子的感觉，但只有不到1分钟的时间，排泄出宿便便会感觉很舒服，大多数人没有不适的感觉。
传统的灌肠是先向大肠内灌入一定量的液体，当患者有便意时再去厕所排泄，灌入时患者不但很难受，还会由于便意剧烈而造成尴尬。而且灌肠只能灌注降结肠以下，而结肠水疗却能清洗整条结肠，排除毒素并充分恢复结肠的生理功能。
